被害人能否对刑事判决书中的赃款追缴申请执行
不可以。
刑事裁判中的追缴或责令退赔，既不应由被害人申请执行，也不能由刑事审判庭移送执行，只能待被害人另行提起民事赔偿之诉后，待民事判决生效后，可以以诉讼主体中的权利人身份申请人民法院执行。
《最高人民法院关于刑事裁判涉财产部分执行的若干规定》第十一条
被执行人将刑事裁判认定为赃款赃物的涉案财物用于清偿债务、转让或者设置其他权利负担，具有下列情形之一的，人民法院应予追缴：
(一)第三人明知是涉案财物而接受的；
(二)第三人无偿或者以明显低于市场的价格取得涉案财物的；
(三)第三人通过非法债务清偿或者违法犯罪活动取得涉案财物的；
(四)第三人通过其他恶意方式取得涉案财物的。
第三人善意取得涉案财物的，执行程序中不予追缴。作为原所有人的被害人对该涉案财物主张权利的，人民法院应当告知其通过诉讼程序处理。